MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 36483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	A	7	7	30	36	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
2	NC_022351	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	543945415
3	NC_022351	ACAA	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	543945415
4	NC_022351	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
5	NC_022351	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945415
6	NC_022351	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945415
7	NC_022351	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945415
8	NC_022351	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945415
9	NC_022351	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
10	NC_022351	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945415
11	NC_022351	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
12	NC_022351	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945415
13	NC_022351	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945415
14	NC_022351	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945415
15	NC_022351	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945415
16	NC_022351	A	7	7	828	834	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
17	NC_022351	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945415
18	NC_022351	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945415
19	NC_022351	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945415
20	NC_022351	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945415
21	NC_022351	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	543945415
22	NC_022351	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
23	NC_022351	CTAG	2	8	1144	1151	25 %	25 %	25 %	25 %	543945415
24	NC_022351	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945415
25	NC_022351	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	543945415
26	NC_022351	A	7	7	1231	1237	100 %	0 %	0 %	0 %	543945415
27	NC_022351	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945415
28	NC_022351	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945415
29	NC_022351	AAAAT	2	10	1292	1301	80 %	20 %	0 %	0 %	543945415
30	NC_022351	A	6	6	1478	1483	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
31	NC_022351	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
32	NC_022351	T	8	8	1580	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	543945416
33	NC_022351	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945416
34	NC_022351	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945416
35	NC_022351	A	8	8	1653	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
36	NC_022351	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945416
37	NC_022351	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945416
38	NC_022351	TTAT	2	8	1768	1775	25 %	75 %	0 %	0 %	543945416
39	NC_022351	A	6	6	1781	1786	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
40	NC_022351	A	6	6	1851	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
41	NC_022351	ACAA	2	8	1921	1928	75 %	0 %	0 %	25 %	543945416
42	NC_022351	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945416
43	NC_022351	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945416
44	NC_022351	A	6	6	2065	2070	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
45	NC_022351	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945416
46	NC_022351	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
47	NC_022351	T	6	6	2114	2119	0 %	100 %	0 %	0 %	543945416
48	NC_022351	A	7	7	2269	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
49	NC_022351	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	543945416
50	NC_022351	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945416
51	NC_022351	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945416
52	NC_022351	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945416
53	NC_022351	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945416
54	NC_022351	GTAT	2	8	2649	2656	25 %	50 %	25 %	0 %	543945417
55	NC_022351	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945417
56	NC_022351	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945417
57	NC_022351	GAAG	2	8	2771	2778	50 %	0 %	50 %	0 %	543945417
58	NC_022351	TAGT	2	8	2784	2791	25 %	50 %	25 %	0 %	543945417
59	NC_022351	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945417
60	NC_022351	CT	3	6	2951	2956	0 %	50 %	0 %	50 %	543945417
61	NC_022351	A	6	6	2957	2962	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
62	NC_022351	GAAA	2	8	2978	2985	75 %	0 %	25 %	0 %	543945417
63	NC_022351	A	7	7	3056	3062	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
64	NC_022351	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945417
65	NC_022351	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945417
66	NC_022351	TAAA	2	8	3258	3265	75 %	25 %	0 %	0 %	543945417
67	NC_022351	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
68	NC_022351	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
69	NC_022351	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	543945417
70	NC_022351	CT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	0 %	50 %	543945417
71	NC_022351	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945417
72	NC_022351	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945417
73	NC_022351	AC	3	6	3404	3409	50 %	0 %	0 %	50 %	543945417
74	NC_022351	TA	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	543945417
75	NC_022351	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945417
76	NC_022351	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945417
77	NC_022351	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
78	NC_022351	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543945417
79	NC_022351	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945417
80	NC_022351	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
81	NC_022351	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
82	NC_022351	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945417
83	NC_022351	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543945417
84	NC_022351	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945417
85	NC_022351	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945417
86	NC_022351	ATGA	2	8	4115	4122	50 %	25 %	25 %	0 %	543945417
87	NC_022351	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945417
88	NC_022351	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
89	NC_022351	ATTT	2	8	4193	4200	25 %	75 %	0 %	0 %	543945417
90	NC_022351	GAAT	2	8	4272	4279	50 %	25 %	25 %	0 %	543945417
91	NC_022351	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945417
92	NC_022351	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
93	NC_022351	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
94	NC_022351	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
95	NC_022351	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
96	NC_022351	A	6	6	4664	4669	100 %	0 %	0 %	0 %	543945417
97	NC_022351	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945417
98	NC_022351	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945417
99	NC_022351	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945417
100	NC_022351	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945418
101	NC_022351	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	543945418
102	NC_022351	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945418
103	NC_022351	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945418
104	NC_022351	T	6	6	5008	5013	0 %	100 %	0 %	0 %	543945418
105	NC_022351	CATC	2	8	5057	5064	25 %	25 %	0 %	50 %	543945418
106	NC_022351	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945418
107	NC_022351	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	543945418
108	NC_022351	AATC	2	8	5171	5178	50 %	25 %	0 %	25 %	543945418
109	NC_022351	T	7	7	5248	5254	0 %	100 %	0 %	0 %	543945418
110	NC_022351	GCAT	2	8	5287	5294	25 %	25 %	25 %	25 %	543945419
111	NC_022351	AT	3	6	5300	5305	50 %	50 %	0 %	0 %	543945419
112	NC_022351	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945419
113	NC_022351	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945419
114	NC_022351	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945419
115	NC_022351	T	6	6	5548	5553	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
116	NC_022351	T	6	6	5694	5699	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
117	NC_022351	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945419
118	NC_022351	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945419
119	NC_022351	ACAA	2	8	5773	5780	75 %	0 %	0 %	25 %	543945419
120	NC_022351	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543945419
121	NC_022351	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945419
122	NC_022351	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945419
123	NC_022351	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945419
124	NC_022351	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
125	NC_022351	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945419
126	NC_022351	T	6	6	6145	6150	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
127	NC_022351	TCTT	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	543945419
128	NC_022351	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945419
129	NC_022351	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945419
130	NC_022351	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945419
131	NC_022351	T	6	6	6337	6342	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
132	NC_022351	A	6	6	6392	6397	100 %	0 %	0 %	0 %	543945419
133	NC_022351	T	6	6	6452	6457	0 %	100 %	0 %	0 %	543945419
134	NC_022351	TACT	2	8	6716	6723	25 %	50 %	0 %	25 %	543945420
135	NC_022351	GTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945420
136	NC_022351	TGA	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945420
137	NC_022351	TTTG	2	8	6761	6768	0 %	75 %	25 %	0 %	543945420
138	NC_022351	TTG	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945420
139	NC_022351	GAAA	2	8	6873	6880	75 %	0 %	25 %	0 %	543945420
140	NC_022351	TA	3	6	6901	6906	50 %	50 %	0 %	0 %	543945420
141	NC_022351	A	6	6	6991	6996	100 %	0 %	0 %	0 %	543945420
142	NC_022351	TATT	2	8	6997	7004	25 %	75 %	0 %	0 %	543945420
143	NC_022351	TTG	2	6	7075	7080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945420
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162	NC_022351	TTTG	2	8	7784	7791	0 %	75 %	25 %	0 %	543945420
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172	NC_022351	GAAC	2	8	8200	8207	50 %	0 %	25 %	25 %	543945421
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181	NC_022351	A	7	7	8608	8614	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
182	NC_022351	A	6	6	8679	8684	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
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243	NC_022351	ATG	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945421
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249	NC_022351	GAT	2	6	11651	11656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945421
250	NC_022351	A	6	6	11685	11690	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
251	NC_022351	A	6	6	11799	11804	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
252	NC_022351	GATT	2	8	11806	11813	25 %	50 %	25 %	0 %	543945421
253	NC_022351	TAC	2	6	11823	11828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945421
254	NC_022351	A	6	6	11852	11857	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
255	NC_022351	CTTT	2	8	11870	11877	0 %	75 %	0 %	25 %	543945421
256	NC_022351	ATT	2	6	12060	12065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945421
257	NC_022351	GTG	2	6	12081	12086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543945421
258	NC_022351	GAA	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945421
259	NC_022351	ATC	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945421
260	NC_022351	AT	3	6	12277	12282	50 %	50 %	0 %	0 %	543945421
261	NC_022351	GCT	2	6	12329	12334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945421
262	NC_022351	GTT	2	6	12350	12355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945421
263	NC_022351	A	6	6	12515	12520	100 %	0 %	0 %	0 %	543945421
264	NC_022351	T	6	6	12524	12529	0 %	100 %	0 %	0 %	543945421
265	NC_022351	AGC	2	6	12604	12609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945421
266	NC_022351	CA	3	6	12622	12627	50 %	0 %	0 %	50 %	543945421
267	NC_022351	A	6	6	12694	12699	100 %	0 %	0 %	0 %	543945422
268	NC_022351	AG	3	6	12728	12733	50 %	0 %	50 %	0 %	543945422
269	NC_022351	AGA	2	6	12757	12762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945422
270	NC_022351	ATT	2	6	12763	12768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945422
271	NC_022351	T	6	6	12807	12812	0 %	100 %	0 %	0 %	543945422
272	NC_022351	ATT	2	6	12897	12902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945422
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383	NC_022351	AAAT	2	8	17218	17225	75 %	25 %	0 %	0 %	543945426
384	NC_022351	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	543945426
385	NC_022351	CAC	2	6	17313	17318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543945426
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400	NC_022351	AAAG	2	8	18229	18236	75 %	0 %	25 %	0 %	543945427
401	NC_022351	AGA	2	6	18237	18242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945427
402	NC_022351	AGC	2	6	18255	18260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945427
403	NC_022351	CGT	2	6	18262	18267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543945427
404	NC_022351	ATC	2	6	18310	18315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945427
405	NC_022351	GTA	2	6	18343	18348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945427
406	NC_022351	CA	3	6	18461	18466	50 %	0 %	0 %	50 %	543945427
407	NC_022351	GAT	2	6	18505	18510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945427
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409	NC_022351	TTTG	2	8	18702	18709	0 %	75 %	25 %	0 %	543945427
410	NC_022351	CAAG	2	8	18720	18727	50 %	0 %	25 %	25 %	543945427
411	NC_022351	AAT	2	6	18750	18755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945427
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413	NC_022351	TGTT	2	8	18783	18790	0 %	75 %	25 %	0 %	543945427
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428	NC_022351	A	6	6	19734	19739	100 %	0 %	0 %	0 %	543945428
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433	NC_022351	A	6	6	19942	19947	100 %	0 %	0 %	0 %	543945429
434	NC_022351	A	6	6	19961	19966	100 %	0 %	0 %	0 %	543945429
435	NC_022351	TA	3	6	20020	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	543945429
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440	NC_022351	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	543945429
441	NC_022351	ATA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945429
442	NC_022351	ATT	2	6	20380	20385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945429
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460	NC_022351	ATC	2	6	21254	21259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945430
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478	NC_022351	GAAT	2	8	22419	22426	50 %	25 %	25 %	0 %	543945431
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480	NC_022351	CTT	2	6	22500	22505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
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484	NC_022351	AAGA	2	8	22748	22755	75 %	0 %	25 %	0 %	543945431
485	NC_022351	CTT	2	6	22782	22787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945431
486	NC_022351	ATG	2	6	22796	22801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945431
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500	NC_022351	TTTC	2	8	23936	23943	0 %	75 %	0 %	25 %	543945432

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